历时15个月 云南怒江草果全基因组精细图谱绘制成功

来源:云南发布 2021-01-15 11:01:48
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从20世纪70年代开始

云南省怒江州就开始种植草果

到2020年,种植面积已达111万亩

不仅是全国草果的核心产区

也是当地群众脱贫致富的重要经济作物

  为了提高草果遗传改良效率

培育高产、抗病优质、安全新品种

对从源头创新保障草果产业健康可持续发展

2019年9月

怒江州联合华南农业大学等国内外高校科研院所机构

正式启动草果全基因组测序计划

历时1年零3个月

成功完成草果全基因组测序工作

绘制了精细图谱

并于今年1月13日正式对外发布

通过Nanopore及illumina等测序技术

拼接组装得到2.08G大小的基因组

组装出由1145个contig序列组成的草果参考基因组序列

GC含量为40.9%

最长的contig长度为31.6Mb

N50为4.7Mb

 

 

 

结合HiC测序结果

得到24对染色体的高质量基因组

包括42394个基因

通过转录组、代谢组关联分析

得到草果关键香气物质合成的候选基因一批

草果全基因组精细图谱完成将极大推动草果的全基因组精准育种

为打造国家级草果种质资源圃提供重要基础作用

  撰文:刘文杰

  来源:央视新闻客户端

  资料:怒江州委宣传部

  信息员:欧蓉

责任编辑:刘兵兵
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